معرفی نویسنده

دپارتمان پژوهش کدکول

تیم پژوهش مجموعه کدکول

ژنومیکس در ابر

داده‌های مربوط به ژنومیکس در حال گسترش است. در سال‌های اخیر سازمان‌هایی مانند موسسه ملی سلامت (NIH)  که میزبان بیشتر از پنجاه پتابایت یا به عبارتی دیگر پنجاه میلیون گیگابایت از داده‌های ژنومیکس بوده‌اند، در حال فراهم کردن زیرساخت‌های ابری جهت قرار دادن داده‌‌‌‌‌‌‌‌‌ها در دسترس جامعه پژوهشگران هستند.

چگونه ابزارها و پروتکل‌های تجزیه تحلیل را برای دسترسی و آنالیز این حجم از داد‌ه‌ها در فضای ابری تطبیق داده می‌شوند؟

با این کتاب کاربردی، پژوهشگران کار با داده‌های واقعی و چگونگی کار با الگوریتم‌های ژنومیکس با استفاده از ابزارهای متن باز مانند، GATK، WDL، Doker، و Terra را یاد خواهند گرفت.

  • پیش‌نیازهای ضروری ژنومیکس محاسباتی
  • عملیات پایه‌ای پردازش ابری
  • شروع کار با GATK   و سه تا از بهترین تمرین‌های خط لوله GATK
  • آنالیز اتوماتیک با استفاده از WDL  و Cromwell
  • بالا بردن جریان کاری اجرا در ابر، شامل پردازش موازی و بهینه سازی هزینه‌ها
  • آنالیز تعاملی در ابر با استفاده از ژوپیتر

 

دانلود فایل

کلید واژه ها: فضای ابری ژنومیکس الگوریتم

telegram